遗传图谱构建和QTL定位
遗传图谱也叫连锁遗传图谱(Genetic linkage map),是以基因或者遗传标记之间的连锁和重组交换值构建的图谱。QTL 定位是通过对遗传标记与性状之间相关性的分析,将一个或多个QTL 定位到染色体的遗传标记之间。 华球体育(电子)股份有限公司提供基于基因芯片和高通量测序的高密度遗传图谱构建及QTL 定位服务,助力重要育种价值基因的挖掘。
Sample requirements
材料准备
首先需要构建作图群体进行高质量遗传连锁图的绘制,然后测定作图群体中不同个体或株系的标记基因型;对标记基因型数据进行连锁分析,构建标记连锁图。然后将QTL定位在遗传图谱上,确定QTL与遗传标记间的距离(以重组率表示)。
作图群体
临时作图群体:F1、F2、BC等永久作图群体:RIL、NIL、DH等分子标记
SSRSNP模型选择
区间作图法 IM复合区间作图法 CIM多重区间作图法 MIM
Schematic diagram
技术示意图
结果展示
文章使用Affymetrix 小麦 660K SNP 芯片对六 倍体小麦进行检测。由此得到全长4424.4 cM 包含 11566 个标记的高密度遗传图谱,其中119001 个位 点为SNP 标记。
◎ Cui, F. , Zhang, N. , Fan, X. L. , Zhang, W. , Zhao, C. H. , & Yang, L. J. , et al. (2017). Utilization of a wheat660k snp array-derived high-density genetic map for highresolution mapping of a major qtl for kernel number. Scientific Reports, 7(1), 3788.